湿地保护  上海目前大于100公顷湿地共有27块，总面积近3200平方公里，包括近海及海岸湿地、河流湿地、湖泊湿地和库扩湿地等。其中，近海及海岸湿地面积为3054.01平方公里，包括大小金山三岛、崇明东滩、南汇东滩和九段沙。

    有机肥加工综合利用  到2005年，郊区已建成农工商、宝山、奉贤、崇明、金山等5个畜禽粪便有机肥料处理中心，有机肥料加工能力达到9万吨，带动周边地区畜禽场综合治理。

    农业环境治理  通过农业结构调整、推广施用有机肥和专用肥，种植绿肥以及测土配方平衡施肥技术等途径减少化肥用量；大力推广新型植保器械、使用高效低毒低残留农药和生物农药，强化运用杀虫灯、防虫网等物理综合防治技术减少农药用量。2005年共推广施用有机肥料9万吨、应用面积达到60万亩，种植冬作绿肥30万亩。

    秸杆综合利用  通过扩大禁止焚烧区域范围、利用秸秆制作有机肥以及机械化还田等途径，逐年提高综合利用水平。2005年秸秆还田面积达到158.6万亩，机械化还田率为59.6%，综合利用率达到63.5%。

    垃圾收集处置  覆盖郊区10个区县的“户集、村收、镇运、区处置”的农村生活垃圾收集处置系统已基本建立。农村生活垃圾无害化处置率达60%，密闭化运输率达60%，农村环境卫生面貌得到改变。